Das Fördergebiet war ursprünglich rund 7.016 ha groß und erstreckte sich entlang des Altmühltals von Colmberg im Landkreis Ansbach bis Treuchtlingen im Landkreis Weißenburg-Gunzenhausen über insgesamt 19 Gemeinden.
Nach der Entscheidung des Landkreis Weißenburg-Gunzenhausen, sich an Projekt II nicht weiter zu beteiligen, umfasst das Fördergebiet nur noch die Anteile im Landkreis Ansbach mit einer Größe von 4.398 ha. Es reicht von Colmberg bis Ornbau und erstreckt sich über 11 Gemeinden.
Große Anteile davon sind als Natura 2000-Gebiete ausgewiesen. Im Fördergebiet liegen das FFH-Gebiet „Obere Altmühl mit Brunst-Schwaigau“ (6830-371) und das Vogelschutzgebiet „Altmühltal mit Brunst-Schwaigau und Altmühlsee“ (6728-471).